CDS
Accession Number | TCMCG024C01454 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_021970502.1 |
Location | join(44890926..44891015,44891476..44892531,44895305..44895785,44895913..44896279,44896382..44896522,44896718..44896961,44897047..44897757,44898372..44898569,44898676..44899283,44899354..44899405,44899484..44900093,44900176..44900384,44900456..44900979,44901078..44901182,44901245..44901311,44901980..44902057,44902184..44902252,44902408..44902446) |
Gene | LOC110865534 |
GeneID | 110865534 |
Organism | Helianthus annuus |
Protein
Length | 1882aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA396063 |
db_source | XM_022114810.2 |
Definition | E3 ubiquitin-protein ligase PRT6 isoform X1 [Helianthus annuus] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
Sequence
CDS: ATGTTCAGGATGGAGATTGATTCACCATCATCATCATCATCATCTGAACTTGATGCACCTATTCTTTCACCAAAAGATCGTATACTCAAGAGGCTAGCTCTAATAGATGTGTCTGAAGAGAGTCTTGAGCATATGCAGCCCGGGATAATCGCATATGTTAAAAGAAACAGTTCCAGATTACAAGAAATTTTTAATGCGATTTTACCATCTGATTATGAGATTCAGACCGCCATTGAAGCAGAGGCAGACCCTGGCATTGAGGATTTACTACATGAAAGCATGGTTTGGTTGCAGTGGTTGATGTTTGATGGTGATCCTGTTGACATGCTACAACGACTGGCGTTGTTGAATGTTGGGCAACGTGGTGTTTGTGGATCCGTGTGGGCCAGTGGTGAGATGGCATACCGTTGTAGAACATGCGAAATTGATCCCACTTGTGCAATTTGCGTCCCGTGTTTTGTAAACGGTGATCATAAAGATCATGATTACTCAGTTATAAAAACAGGCAGTGGATGCTGTGATTGTGGGGACGTGACAGGATGGAAACGTAGCGGATTTTGTTCTAAACATAAAGGAGCAGAACAAATACAACCACTTCAAGAAGATATTGCAAAGACTCTAGGTCCTGTTTTGGATTGTCTTCTTCGTCACTGGAAAAACAGTTTATTATTCATGGATAATGCTTCAGAACCAAAAGCGGTTGCAGATGTGCTGACATCAGCAGTGGTGGGGATGCTTTTGGAATTTTGTAAGTGCAGTGAAAGCTTGCTTGGTTTTGTTTCCGGAAGATTATGCTATGAGGTTGATTTGCTGGACGTTCTCGTAAGGGCAGAGCGGTTTTTGAGCTTGGATGCTGTCTCAAAGCTTCACAAACTACTTTTAAAGTTGCTAAGTGATCCTTTTTTCAAATACGAGTTTGCAAAGGCTTTTATAAAGTATTATCCCACAGTCGTAAATGACGTTTTGCAAGAGAGTACAGATGCTACTTTTCAGAACCTACCACTACTATCAACATTCGGGGTTCAGATTTTCACTGTCCCTACCCTGACTCCACGTCTCGTTAAGGAAATGGATCTTTTAACCATGCTTTTGGAGTGTTTGAGCAAGATATTCAGTTCTTGTTCTGGACAGGATCATCGACTAGAAGTTTCAGAGTGGGAAGATATGTACAAAACAACACAATATGTTGTTAAACATATTGAATATGTCATGAGCCATTCAACTATACCAAAATACATGACATGTGAGAGGCGTGGCATTTCCAGAACGTGGATGAAACTATTAGGTTTTTTGCAGGGAATGAACCCTGAAAAAAGAGAAATACATATTCATGTAGAAGAAGAAAATGAAAATATCGATTTACCTTTTCTTTTAGTCGGTTCCATTGCAAATATTAATGTTTTATTAGTAGCTGGTGCGTTTTCCACCAAAGAGGAATCAGTTTCCACTATAAATGTGAAGGTAGTTAATGAACAGGACTCTTTTTCTAGTCTAACTTCGTTGGATTATGAAATGAAGGCTGTTGAAGGAAATGATGCTCGTGTTTCAGTTTTGACTTCAGTTTCATGGTTAATCTTCGAGTGTTTACGGGCCATTGAATACTGGTTGAAAGCTAACAATACATCAGGTTTTGGAGGTCATGGGGTGGAAGGGGATTATACAAATGAATTAGAGGTTTTAAGTTTGGCAGATTGGCCAGAAATTGAATATGATGTTAGTTCACAAGAGATATCGGTGCATATCCCGTTGCATCGTTTGCTCTCATTGGCTTTACAAAGAGCATTGAAGAGGTGTTATGGTGAATCTGAGTCATCTGCTTATGGTGATTTTTTTGGCCACGTGTTAGGTGGCTGCCACCCGTACGGATTCTCTGCTTTTGTGATGGAACATCCTCTGCGTATTAGGGTTTTCTGTAGTCAAGTTCGTGCGGGGATGTGGCGGAAGAATGGTGATGCAGCACTAGCATCTTACGAGTGGTATCGTTTTGTTAAATGGTCAGAGCAGGGTTTGGAACTTGATATATTTCTTCTACAGTGCTGTGCTGCATTAGCTCCAGCAGACTTTTATATTGCTAGAATCGTAGAACGTTTTGGTCTATCAGATTACCTTTCTTTGAATATGGAAAGAGCTAACGAGTATGAACCGGCTTTGGTGCAGGAGATGCTAAATCTTATCATACAAATATTGAAAGAAAGACGATTTTGTGGATTGACTACAGCTCAATGTCTGCAGCGTGAGTTAATTTATAAGTTATCATCCGGCAACGCTACTCACAGTGAACTGGCCAATTCCCTTCCTCGTGACCTTTCTAATGTTGACCAACTTCAACAAGTTCTGGATACCGTAGCTGAGTACACGTATCCATCTGGAACCAAACAGGGTATGTACCAATTGCGTTTAGAGTACTGGAAAGAACTAGATTTGTACCATCCTCGTTGGAATTTACAAGACTTACAAGCTGCAGAAGAAAGATACTTGCGTTTTTGTAATGCTTCGGCTATGGCAAATCAGCTTCCGAAGTGGTCAAAGATTTATCCTCCTCTTAACGGGTTAGCTAAAGTAGCTACATGTAAAACGGTTCTACAAATCATTCGGGCTGTTCTCTTTTACGCACTTTTTACTGATAAGTTGATGGAATCACGTGCTCCGGACGGTGTTCTTGTAACATCTTTACACTTGCTATCATTAGCATTGGACATTTCTCAAGTGCAGATCCAAGGTGGTGATATGGATAATTCTATTCCTCTTTTAGGCTATGCTGGTGAGGAAATATTTACGGGGTTCAATGATGGACATGATCATCAAAGCTTATTATCACTTCTTGTGTCATTAATGAGAAAAAATCAAAAAGAAAACACGTACGGTTTTGTGGAATCTGGTGGGTTTGACCTCTCTTCTTTGATCAAGGATCTTCTTCAGAAATTTGCTGAGCTGGATTCTGGATGCCTAAAAAAATTGCAAATATTAGCACCTGAGGTTGTTAATCTGCTATCTCATTCCAAGCCTAGTAGCGATACAAGTAATAGCGCTTCCATGTCCGACAGTGATAAACGAAAGGCCAAAGCTCGTGAGAGACAAGCTACAATAATGGAAAAAATGAAGGCACAACAGTCAAAATTCATGGAGAACATAAATTCAACTGCAGAGAGTGGCTTAAATGATTCTAGTGATGCTGAAGAAAGAATTTCCGATGTTGCAAACGGTTCAGATGGACATGAGCAAGTAATCTGTTCTCTTTGTCATGATGCCAATTCCAAGTCACCTGTGTCTTTTCTAATTCTTCTCCAGAAATCCAGTGTTGCGAGTTTACTTGATAAAGGTTTCCCATCATGGGAAAAAGACGTTCAAAGGTCTGGGAAGGAGCAAGCTTTAAATAATGATGATACGTTTAATAATCAATCTTCAAGTAGTGTAGAAACGCTAACGTCATCCCAGTTGATGGATTCGGTTCAGAATGCAATTAATGAATTTGCTTCCACCAGTCTGCCACATGAGGTTAATGCTTTTCCTCGATCATCACATGATAATAGCAGTCAAGCAGCCACGTCTTTGGGTGATCTGTTTGAAGAAAGTATGTATACACATATTCTGAACAATGATTTGATGAAGTCCGAGGATCTGTCAGCTGCTAGTTGTAGTTCAAGTTCATATGGCAGTTCAAATGAATCACTTTTGCTTGGAAAATACGTTGCTTCTTTGTATGATGAAATAGCGAATAATCCGTCACCTTCAGAAACTAGAGGGTCCCATAGTAACACAACACCGAGTTCAGTAACTTTAGGTATGACATATGATGGTTTTGGCCCGTCAGATTGCAATGGAATTTATGTTTCTTCCTGTGGGCATGCTGTGCATCAGGGTTGCCTTGATCGTTATCTACCGTCACTGAAAGAAAGAGATTCTAGAAGAACTGATCTTGAAGGAGGTCATATTGTGGATCCACGTCAGGGGGAGTTTTTATGTCCTGCTTGTCGTGGACTTGCAAATTCTATTTTACCTGATTTACCTAGAGAAGAAACAAAGGACATCTGGCAATCAAAAAGTCAAAATCTATTCCCTTCAGATGTTAATAATGTTTCTCTCCTTAGACGACCACTTTCTCTTTTGCAAGCTGCAGCTGATGTTTCTAGAAGAAATGAAATTTTAAGGGCTATTCCAGTGCAACAAAAAAGACAAAAAGACACAAATCTAGAATATATGGTTCCTTTGCTACGTGAATTGTATTTCCCGGGAAATGACAAAGTTTCAGGATCGAGTCGGGTAAGTGACTCGATGATCATGTGGGACACCCTCAAATATTCCCTTGTATCTACAGAAATAGCTGCTAGATCCGAAAAGACTTCTTCAGCTACCATTCTTAGCACTGGTGCCTTGTATGAAGAACTAAGATCTTCGAATGGGTTTATTTTATCATTATTACTGAAAATTGCTCAAAAAAACCGAGTCCAAAGTTCTCTTGATATTCCCTTAAGATTATGGTGTACTCAGCAGTTCGCAAAGTCTATTTGTTGTGTTGACACTCTCAATGAACCACGCAATGACGCCTATAGAGTTGGGGAATATATGACGAGCACGTTGGGAAGCACTGACATGAGCATACGATTCCCTAATCTTCAAGTTTGGGCGATGGCATCGTATCCTGTACTTGCATCTGATGCGTTTTCAACTTTAATGTGGATCCTTTTTTGTCTTCCGGTCCCGTTTATGTACTCTGAGAAAACATTCTTTCCTCTTGTTCATATATGCTATGTTGTCTCCATAACTCAGGCCGCAATAACATATATCGGAAGAAATGAATCTATACATGATTTCCGTCACCATGATTCTCTTCTCAGTGACATTTTCAAATTCGTGGGTGAACATGGATTCTTAAAACAGTACTTTGTTTGCAACTATATCAACAACTCTTGTGATATCAACGAGTCTATTCGTAGGCTAAGCTTTCCGTTTCTACGAAGGTGTGCCATCCTGTGGAAATTAATGAACTCTTCAACTTCATCACCATTTAGTGGGGTCCTTAGATCATCAAAAACATTTGAAGATAGAATGGATCATGCTTCTGGCACGCTTAACGAAACTATTGAAATCGAGGAGTTGGAGAAGGTGTTTAAGATTCCACCACTGGACAACATAGTTAATGATGAGCTGTCACGATCTTTGGTTAAGAAATGGTTGCAACACATTGCAAAGGATTTTAAAGTTAATAATCCTTCAGGGGTTTTGCACTTAACCCCTGTAGTCCCAGTTAAGTTAATGGTCTTGCCTTATCTCTACCAAGATCTCTTGCAAAGATACATGAAATGGAAGTGTGTTAACTGTGGAGCTGCTCAGGATAAACCTGCATTATGCTTGTTGTGTGGTTTATTGTGCTCACCAAGATGGAAGACGTGCTGCAGGGATGACACATGCCAAACTCATGCAATGTCTTGTGGTGCTGGTACTGGTGTATTTCTGTTGATTAGGGAAACTAGAATATTACTTCAAAGATCAGCTCATCAAGCATTTTGGCCGTCTCCTTACCTGGATGCGTTTGGTGAAGAGGACATTGGAATGCGTAGGGGAAAGCCGTTATATTTAAATGAAGAACGCTATGCGGCCTTAAGTCACATGGTGGCTTCTCATGGTATTGGTCGCAGTTCAAAAGTGTAG |
Protein: MFRMEIDSPSSSSSSELDAPILSPKDRILKRLALIDVSEESLEHMQPGIIAYVKRNSSRLQEIFNAILPSDYEIQTAIEAEADPGIEDLLHESMVWLQWLMFDGDPVDMLQRLALLNVGQRGVCGSVWASGEMAYRCRTCEIDPTCAICVPCFVNGDHKDHDYSVIKTGSGCCDCGDVTGWKRSGFCSKHKGAEQIQPLQEDIAKTLGPVLDCLLRHWKNSLLFMDNASEPKAVADVLTSAVVGMLLEFCKCSESLLGFVSGRLCYEVDLLDVLVRAERFLSLDAVSKLHKLLLKLLSDPFFKYEFAKAFIKYYPTVVNDVLQESTDATFQNLPLLSTFGVQIFTVPTLTPRLVKEMDLLTMLLECLSKIFSSCSGQDHRLEVSEWEDMYKTTQYVVKHIEYVMSHSTIPKYMTCERRGISRTWMKLLGFLQGMNPEKREIHIHVEEENENIDLPFLLVGSIANINVLLVAGAFSTKEESVSTINVKVVNEQDSFSSLTSLDYEMKAVEGNDARVSVLTSVSWLIFECLRAIEYWLKANNTSGFGGHGVEGDYTNELEVLSLADWPEIEYDVSSQEISVHIPLHRLLSLALQRALKRCYGESESSAYGDFFGHVLGGCHPYGFSAFVMEHPLRIRVFCSQVRAGMWRKNGDAALASYEWYRFVKWSEQGLELDIFLLQCCAALAPADFYIARIVERFGLSDYLSLNMERANEYEPALVQEMLNLIIQILKERRFCGLTTAQCLQRELIYKLSSGNATHSELANSLPRDLSNVDQLQQVLDTVAEYTYPSGTKQGMYQLRLEYWKELDLYHPRWNLQDLQAAEERYLRFCNASAMANQLPKWSKIYPPLNGLAKVATCKTVLQIIRAVLFYALFTDKLMESRAPDGVLVTSLHLLSLALDISQVQIQGGDMDNSIPLLGYAGEEIFTGFNDGHDHQSLLSLLVSLMRKNQKENTYGFVESGGFDLSSLIKDLLQKFAELDSGCLKKLQILAPEVVNLLSHSKPSSDTSNSASMSDSDKRKAKARERQATIMEKMKAQQSKFMENINSTAESGLNDSSDAEERISDVANGSDGHEQVICSLCHDANSKSPVSFLILLQKSSVASLLDKGFPSWEKDVQRSGKEQALNNDDTFNNQSSSSVETLTSSQLMDSVQNAINEFASTSLPHEVNAFPRSSHDNSSQAATSLGDLFEESMYTHILNNDLMKSEDLSAASCSSSSYGSSNESLLLGKYVASLYDEIANNPSPSETRGSHSNTTPSSVTLGMTYDGFGPSDCNGIYVSSCGHAVHQGCLDRYLPSLKERDSRRTDLEGGHIVDPRQGEFLCPACRGLANSILPDLPREETKDIWQSKSQNLFPSDVNNVSLLRRPLSLLQAAADVSRRNEILRAIPVQQKRQKDTNLEYMVPLLRELYFPGNDKVSGSSRVSDSMIMWDTLKYSLVSTEIAARSEKTSSATILSTGALYEELRSSNGFILSLLLKIAQKNRVQSSLDIPLRLWCTQQFAKSICCVDTLNEPRNDAYRVGEYMTSTLGSTDMSIRFPNLQVWAMASYPVLASDAFSTLMWILFCLPVPFMYSEKTFFPLVHICYVVSITQAAITYIGRNESIHDFRHHDSLLSDIFKFVGEHGFLKQYFVCNYINNSCDINESIRRLSFPFLRRCAILWKLMNSSTSSPFSGVLRSSKTFEDRMDHASGTLNETIEIEELEKVFKIPPLDNIVNDELSRSLVKKWLQHIAKDFKVNNPSGVLHLTPVVPVKLMVLPYLYQDLLQRYMKWKCVNCGAAQDKPALCLLCGLLCSPRWKTCCRDDTCQTHAMSCGAGTGVFLLIRETRILLQRSAHQAFWPSPYLDAFGEEDIGMRRGKPLYLNEERYAALSHMVASHGIGRSSKV |